生信分析生信模式肿瘤学示例场景
肿瘤免疫浸润与生存分析
用 TCGA 肺腺癌的表达和临床数据,估计免疫细胞浸润比例,按中位数把 CD8+ T 细胞浸润分高低两组做 Kaplan-Meier 和多因素 Cox 回归,看它是否是独立预后因素。
智能体怎么做
- 获取数据下载表达矩阵与临床随访信息,按样本条形码对齐,剔除随访缺失的病例。
- 浸润估计用两种去卷积方法分别估计免疫细胞比例,比较结果一致性。
- 生存分析绘制 KM 曲线并做 log-rank 检验,在多因素 Cox 模型中校正年龄、分期等变量,检查比例风险假设。
- 整理交付输出生存曲线、森林图和结果表,并写明分组方式对结论的影响。
产出示例
示意图 · 基于模拟数据绘制,展示这类任务通常交付的图表,不是应用的运行截图。
