基因组学
基因组测序、预处理、变异与注释工作流。
57 项技能
- 测序读段比对
- SAM、BAM与CRAM文件处理
- FASTQ质量评估
- 基因组结构与功能注释
这个模式擅长什么
组学分析与生信流程，含 25 个插件与分析内核。在这个模式下，智能体会特别注意：
- 生信分析内核：每一步记录输入、参数与产物
- 结论必须有分析结果作为证据
- 公开数据库与 GEO 等数据可直接检索下载
生信模式的插件
共 25 个插件、528 项技能，标注「默认」的会在第一次进入时自动安装，其余可在「插件」页一键安装。
测序与组学11
群体遗传学
群体结构、关联分析与进化遗传工作流。
32 项技能
- 基因渗入与群体混合检测
- 群体等位基因频率分析
- 基因型与表型关联分析质控
- GWAS关联分析
表观基因组学
DNA甲基化、染色质与调控元件分析。
28 项技能
- ATAC-seq染色质可及性分析
- 序列驱动的调控效应预测
- 组蛋白ChIP-seq分析
- 染色质环与增强子-启动子互作
转录组学
RNA测序、表达、剪接与转录调控分析。
31 项技能
- 转录与翻译调控元件分析
- 可变剪接分析
- Bulk RNA-seq差异表达分析
- 融合转录本检测
单细胞与虚拟细胞
单细胞、多模态与虚拟细胞分析。
39 项技能
- 单细胞CNV推断
- scRNA-seq预处理
- scATAC-seq预处理
- 单细胞多组学预处理与整合
空间组学
空间转录组、空间定位与空间多组学分析。
14 项技能
- 空间ATAC与空间表观组分析
- 空间转录组解卷积与细胞映射
- 空间域识别
- 空间代谢组与质谱成像分析
蛋白质组学
蛋白鉴定、定量、互作与修饰分析。
17 项技能
- DIA蛋白质组分析
- 蛋白质质谱数据处理
- 蛋白质翻译后修饰分析
- 蛋白质丰度定量
代谢组学
靶向与非靶向代谢组及暴露组学分析。
18 项技能
- 暴露组学分析
- 代谢标志物发现
- 稳定同位素示踪与代谢流分析
- ICP-MS离子组与金属组分析
宏基因组与微生物组
微生物分类、宏基因组与功能分析。
36 项技能
- 16S与ITS扩增子分析
- 抗微生物耐药基因检测
- 宿主与微生物互作分析
- 宏基因组功能组成分析
多组学整合
多组学数据融合、建模与网络整合。
10 项技能
- G&T-seq基因组与转录组联合分析
- DIABLO监督式多组学建模
- 多组学数据对齐与标准化
- 多组学联合解释与验证
网络与系统生物学
分子网络、调控网络与系统生物学分析。
15 项技能
- GSEA与样本级基因集评分
- WGCNA共表达网络
- 微生物群落代谢网络
- SBML生物网络建模
临床与转化7
临床基因组学
临床变异注释、评级与遗传诊断。
10 项技能
- HPO表型与疾病匹配
- ACMG与AMP胚系变异分类
- 罕见病基因组诊断
- 变异致害性与剪接效应预测
肿瘤基因组学
肿瘤突变、负荷、进化与异质性分析。
22 项技能
- 肿瘤克隆结构与进化
- 体细胞变异临床解读与驱动基因分析
- HRD评分与解释
- 肿瘤纯度与瘤内异质性
液体活检
ctDNA、CTC、EV 与液体活检分析。
9 项技能
- cfDNA甲基化早筛与组织溯源
- 细胞外囊泡RNA分析
- ctDNA动态与MRD监测
- 液体活检检测性能验证
免疫组学
免疫浸润、受体组学与免疫治疗预测。
23 项技能
- CyTOF归一化与双联体去除
- 高维流式细胞聚类与表型鉴定
- BCR抗体谱系重建
- 免疫受体库多样性与克隆追踪
药物基因组学
药物代谢、反应、剂量与毒性预测。
10 项技能
- CYP450星等位基因与代谢表型
- 药物基因组反应与不良反应解读
- 他克莫司基因型指导剂量
- 华法林基因型指导剂量
精准医学
生物标志物、患者分层与临床决策支持。
11 项技能
- 临床药物安全性信号评估
- 诊断生物标志物性能评估
- 患者分层与精准治疗匹配
- 治疗反应预测与异质性分析
AI医学影像
影像组学、医学影像深度学习与数字病理。
22 项技能
- 医学影像深度学习模型开发
- 放射组学特征提取与建模
- 放射影像-病理-组学融合
- 数字病理全切片分析
结构、药物与设计4
结构生物学
结构预测、分子模拟与蛋白设计。
19 项技能
- 蛋白质单体与同源多聚体结构预测
- 生物大分子复合物结构预测
- 全原子蛋白与复合物设计
- 蛋白质序列逆折叠设计
AI药物发现
靶点、QSAR、ADMET、筛选与分子生成。
25 项技能
- AI蛋白质-配体对接
- 药物-靶点结合活性数据检索
- 生成式分子设计与ADMET优化
- 逆合成路线规划
生物基础模型
序列、蛋白、细胞与多模态生物基础模型。
8 项技能
- Evo 2基因组序列建模
- scGPT单细胞表征与注释
- Nicheformer空间细胞表征
- ESM3蛋白质生成与结构建模
合成生物学
DNA、CRISPR、基因线路与代谢工程设计。
17 项技能
- DNA组装与分子克隆
- 代谢网络建模与菌株优化
- 实验室自动化与液体工作站
- CRISPR碱基编辑设计与结果评估
专题与通用3
衰老与长寿生物学
衰老时钟、多组学、细胞衰老与干预预测。
3 项技能
- DNA甲基化年龄与衰老速度评估
- Olink器官特异性蛋白质衰老时钟
- 细胞衰老与SASP证据分析
法医基因组学
STR、VNTR、SNP 与亲缘关系分析。
10 项技能
- 祖先SNP
- IBD分析
- 身份SNP
- 亲缘关系分析
通用科研与数据服务
默认通用科研工作流与共享生物医学数据 MCP。
42 项技能 · 25 个数据工具
- API与外部系统集成
- 生信分析代理可靠性评测
- 生物医学知识图谱与RAG
- 数据库版本与分析结论漂移审计
四步完成一个任务
- 1
切换到生信模式
左上角品牌旁边选择「生信模式」。第一次进入会自动安装默认插件。
- 2
描述你的任务
用一句话写清研究问题和材料，可以拖入文件、选择文献或指定插件。
- 3
确认方案并执行
智能体先和你确认目标与方案，再检索资料、运行代码、生成文件，每一步都能展开查看。
- 4
查看交付
在右侧预览报告、图表、表格和脚本，文件保存在你电脑上的项目文件夹里。
可以这样提问
以下是应用里生信模式的推荐任务，复制后把《》里的内容换成你的课题即可。
梳理《GLP-1 药物的长期安全性》的临床证据、争议与研究空白
制作《阿尔茨海默病早期筛查》的组会或开题汇报 PPT
绘制《单细胞测序研究》的分析流程、机制假设与多面板科研图
基于真实数据与分析结果撰写《肿瘤免疫微环境的单细胞研究》论文，输出含公式的 Word 文稿
对《差异表达基因列表》做富集分析，并解释关键通路的生物学意义
精读《一篇单细胞图谱论文》，梳理样本、分析流程与主要发现
为《候选靶点的功能验证》设计细胞与动物实验方案
围绕《肿瘤早筛标志物》撰写国自然申请书的科学问题与研究方案
相关案例
每个案例都附有提示词、执行步骤和产出。
真实产出生信分析生信模式真实运行
健康人 PBMC 细胞类型注释：三种方法一致性分析
帮我基于 CellTypist、SingleR 与经典 Marker 基因，对健康人 PBMC 进行细胞类型注释一致性分析。
示意图生信分析生信模式
GWAS 汇总统计的孟德尔随机化分析
用公开的 GWAS 汇总统计，以 BMI 为暴露、2 型糖尿病为结局做两样本孟德尔随机化：筛选工具变量，跑 IVW、MR-Egger 和加权中位数，做异质性与多效性检验，画散点图和森林图。
示意图生信分析生信模式
肿瘤免疫浸润与生存分析
用 TCGA 肺腺癌的表达和临床数据，估计免疫细胞浸润比例，按中位数把 CD8+ T 细胞浸润分高低两组做 Kaplan-Meier 和多因素 Cox 回归，看它是否是独立预后因素。
示意图生信分析生信模式
差异表达基因的富集分析与通路解读
这是两组样本的 DESeq2 结果（deg.csv），请筛选 padj<0.05 且 |log2FC|>1 的基因，做 GO 与 KEGG 富集分析，画气泡图，并解释前 5 条通路的生物学意义。
常见问题
可以直接用 GEO 等公开数据吗？
可以。告诉它数据集编号即可，智能体会下载数据并按确认后的方案分析；也可以分析你本地的 FASTQ、表达矩阵、h5ad 等文件。
分析在哪里运行？
在你的电脑上运行，生信模式会启用独立的 Python 分析环境，数据和结果都保存在本地项目里。大型比对或组装任务请预留足够的磁盘空间。
需要会写代码吗？
不需要。用中文描述任务即可，智能体会自己写代码、运行并解释结果；代码和中间文件都会保留，会写代码的话可以随时查看和修改。
结果能直接用于论文吗？
每一步的方法、参数和脚本都会保留，便于复查和复现。用于投稿前，结论和图表仍需要你结合专业判断审核。