生信分析生信模式遗传流行病学示例场景
GWAS 汇总统计的孟德尔随机化分析
用公开的 GWAS 汇总统计,以 BMI 为暴露、2 型糖尿病为结局做两样本孟德尔随机化:筛选工具变量,跑 IVW、MR-Egger 和加权中位数,做异质性与多效性检验,画散点图和森林图。
智能体怎么做
- 数据准备核对两份汇总统计的基因组版本、效应等位基因与样本祖源,统一后再合并。
- 工具变量按显著性阈值与连锁不平衡去冗余筛选 SNP,计算 F 统计量排除弱工具变量。
- 因果估计运行多种 MR 方法并比较方向是否一致,做 Cochran Q、MR-Egger 截距与留一法敏感性分析。
- 结果解读整理结果表与图,说明哪些假设可能不成立、结论的适用边界。
产出示例
示意图 · 基于模拟数据绘制,展示这类任务通常交付的图表,不是应用的运行截图。
